A SIMULATION STUDY OF SNP IN DNA POOLING BY USING SAS PROGRAMING

Abstract

Allelic association study identifies SNPs which are strongly correlated with some specific disease. The aim of case-control study is to identify a few SNPs among a lot of SNPs which are strongly correlated with the disease. However, due to the large number of markers, there are doubtful about multiple comparison problems. So, we will try to verify the problem by using simulation. In many conditions, we can confirm that the smallest p-value of SNPs or thesensitivity and specificity have respectively some distribution by using SAS simulation.;유전자 관계연구는 특정질병과 강한 연연관성을 갖고 있는 SNPs을 확인한다. case-control 연구의 목적은 질병과 강한 연관성을 갖고 있는 많은 SNP 중에서 몇 개의 SNP들을 확인하는 것이다. 그러나 지나치게 많은 marker때문에 multiple comparison problem 에 대해서 의심이 된다. 그래서, 본 논문은 시뮬레이션을 통해서 multiple comparison problem 에 대해서 확인하고자 한다. SAS를 이용하여 여러가지 조건에서 simulation을 수행하여 SNP들의 가장 작은 p-value, 그리고 sensitivity와 specificity의 합이 각각 어떠한 분포를 따르게 되는지 확인 할 수 있다.