Study on trinucleotide repeat sequences in human genome

Abstract

최근 여러 가지 신경정신 질환의 원인 유전자로 지목되고 있는 trinucleotide repeat containing genes이 밝혀지고 있으며 이미 십여가지의 질환유전자들이 발견되었다. 이들 질환들은 공히 유전자내에 포함되어져 있는 세 개의 염기서열의 반복 횟수가 증가하는 특징들을 가지며 이같은 서열 확장 정도를 통해 이들 질환을 유전자 수준에서 진단할 수 있다. 본 연구에서는 인간의 유전체 내에 이 같은 trinucleotide repeat를 포함하는 새로운 유전자들의 존재 가능성을 타진하고 이러한 유전자들을 찾기 위해 human whole genomic library를 대상으로 (CTG)_17 oligonucleotide를 probe로 한 screening을 실시하고 여기서 양성반응을 보이는 lambda phage clones을 대상으로 clone identification을 시도하였다. 이 screening을 통해 이미 알려진 유전자 중의 DMPK, DRPLA 유전자가 포함되어 있음을 확인할 수 있었으며, 이같은 phage clones에 대한 좀 더 효과적인 유전자 cloning strategy를 확립할 수 있었다. 또한 본 연구에서 얻어진 다수의 unidentified clones의 존재들로 미루어 상당한 수의 새로운 유전자가 더 있을 것으로 생각할 수 있으며 새로운 유전자를 찾기 위한 clone pool을 확보함으로써 각 clone에 대한 진전된 연구를 위한 발판을 마련하였다. ; Trinucleotide repeat(TNR) containing genes causing various neuromuscular, neurodegenerative disease have be already revealed 13 at the time being. The diseases are due to increase of trinucleotide repeat number within genes, and are able to be diagnosis by estimation the extent of the TNR expansion. For our study, the possibility of new gene containing TNR is promising, so we constructed genomic DNA library, screened with (CTG)_17 oligonucleotide and tried to identify lambda phage clone with positive signal. Thoughout genomic DNA library screening, two clones which contain well known DMPK gene, DRPLA gene associated with TNR were obtained and moreover effective cloning strategy was established. Many other unidentified clone of this study must be in existence, and the basis for further study was prepared by obtaining clone pool to find new gene.